如果U盘占用空间但看不到文件夹，可能是由于以下几种原因造成的：

1. 文件被隐藏：在U盘上的一些文件可能被设置为隐藏属性，因此无法直接看到。可以通过设置来查看隐藏文件。在Windows系统中，可以打开“查看”选项卡，并勾选“隐藏的项目”选项来查看隐藏文件。

2. 文件夹同步或占用空间的数据被锁定：如果U盘连接的是电脑，并且有其他程序正在使用这些文件，可能会导致文件被锁定而无法查看。此时需要关闭正在使用这些文件的应用程序或进程，然后再次尝试访问这些文件。此外，如果使用同步软件同步了U盘上的文件夹，可能会在本地也创建了文件夹副本或缓存，占用了空间却看不到实际内容。需要检查同步软件的设置和状态，确认是否同步完成或是否有缓存文件占用空间。

3. 文件损坏或系统错误：如果U盘中的某些文件损坏或系统出现错误，可能会导致文件无法正常显示。可以尝试使用系统自带的工具进行磁盘检查和修复，或者尝试使用第三方工具进行修复和恢复文件。

4. 文件实际上是隐藏的不可删除的系统文件：有些U盘在生产时会预留部分空间用于保存系统的配置文件等信息，这部分空间是无法直接看到的，但会占用总容量的一部分。这种情况下的解决方法通常是联系U盘制造商获取相关信息和帮助。此外也要注意避免在U盘上创建和存储过多根目录级别的文件夹和文件，这可能会影响U盘的性能和稳定性。必要时可以使用杀毒软件对U盘进行深度扫描和清除病毒等操作来解决一些异常情况的出现。综上所述如果问题依旧存在可以寻求专业的IT技术人员的帮助以解决该问题。