U盘的文件系统有多种，包括FAT32、NTFS、exFAT等，哪种文件系统更好取决于你的使用需求和场景。

1. FAT32：对于小文件存取以及大多数USB设备兼容性较好，但缺点是不能存储单个大于4GB的文件。如果主要存储需求是传输小文件，FAT32是一个不错的选择。

2. NTFS：是目前最常用的电脑硬盘和U盘的文件系统之一。相比FAT32，NTFS支持更大的文件和大容量存储，有更好的稳定性和安全性。但是，某些较旧的操作系统可能不支持NTFS文件系统。如果你的使用场景主要需要存储大文件或者大量数据，NTFS是一个好的选择。

3. exFAT：专为闪存设备（如U盘、存储卡等）设计的新型文件系统，不仅容量上有很高的支持度，解决了FAT系统单点增大的缺陷，同时还融合了NTFS的某些特色。这是一种介于FAT和NTFS之间的文件系统，对于跨平台兼容性非常好。如果需要在不同操作系统之间频繁传输文件，exFAT是一个很好的选择。

总的来说，哪种文件系统更好取决于你的需求。如果主要存储小文件并且跨平台使用，exFAT可能更好；如果需要存储大文件或大量数据，NTFS可能更适合；如果设备主要是USB设备并且兼容性是主要考虑因素，FAT32可能更好。